R4LOGIC / INVESTIGACIÓN

Investigación molecular, biodiversidad y sistemas científicos

R4Logic aborda preguntas de investigación biológica mediante métodos computacionales, datos públicos y herramientas en desarrollo. Cada línea se presenta con la evidencia disponible, sus criterios de evaluación y las limitaciones metodológicas.

PREPRINT PUBLICADO

Un preprint con resultados y materiales de análisis abiertos

El preprint de ChemRxiv documenta los resultados del estudio CtMGAM y enlaza a un paquete abierto de análisis. Sus hallazgos y límites metodológicos orientan las siguientes etapas de investigación.

PREPRINT PUBLICADO · CHEMRXIV

Chilean Papaya Bioprospecting for Human α-Glucosidase: Near-Native Pose Recovery in CtMGAM Docking

Roberto Pizarro Díaz · 2026 · ChemRxiv

El benchmark de CtMGAM humana recuperó poses de acarbosa casi nativas entre los tres primeros modos en ambas copias cristalográficas. La selección en primer lugar varió entre copias: recuperar una pose y seleccionarla de forma fiable son logros distintos. Un panel inspirado en papaya chilena y un paquete abierto de análisis conectan este hallazgo con la bioprospección computacional. El panel permanece sin priorizar; la actividad biológica requiere ensayos bioquímicos.

Preprint ChemRxiv · no revisado por pares · evidencia computacional

Figura 2 del preprint: se recuperaron poses de acarbosa casi nativas en ambas copias de CtMGAM, pero la selección consistente en primer lugar sólo ocurrió en B/D
Figura 2 · Recuperar una pose no implica seleccionarla en primer lugar. Las dos copias cristalográficas muestran resultados distintos de selección. ChemRxiv · 2026 ↗

CONTINUIDAD DE INVESTIGACIÓN

De CtMGAM a COX-2 y la biodiversidad chilena

Un preprint en ChemRxiv documenta los hallazgos de CtMGAM. El programa continúa con investigaciones sobre COX-2 y biodiversidad a partir de datos públicos.

01PREPRINT PUBLICADO

CtMGAM

Bioprospección de papaya chilena

El estudio evalúa protocolos de docking molecular frente a CtMGAM humana utilizando acarbosa como referencia. Se recuperaron poses casi nativas entre los tres primeros resultados en ambas copias cristalográficas, pero la selección consistente en primer lugar solo ocurrió en una. El panel de compuestos inspirado en Vasconcellea pubescens permanece sin priorizar.

CtMGAM humana · productos naturales · docking molecular

02EN DESARROLLO

COX-2

Extensión de la investigación molecular

La línea COX-2 examina cómo los datos públicos y los métodos computacionales pueden respaldar comparaciones con criterios de evaluación explícitos. El análisis continúa en desarrollo y aún no se presentan resultados consolidados.

COX-2 · modelado molecular · transferencia de workflow

03EN DESARROLLO

Biodiversidad chilena

Biodiversidad subrepresentada en Chile

Mycetozoa Chile estudia la diversidad, distribución y relaciones evolutivas de mixomicetos a partir de registros y secuencias públicas. Estos organismos pertenecen a Amoebozoa. El proyecto busca identificar vacíos en los registros de biodiversidad disponibles.

Mycetozoa · secuencias públicas · bioinformática

INFRAESTRUCTURA DE INVESTIGACIÓN

R4Forge / Anvil

Explorar infraestructura →

Anvil es un prototipo de agente científico en desarrollo dentro de R4Forge. El flujo de trabajo previsto integra validación de entradas, ejecución de herramientas y evaluación de resultados con salidas reproducibles. La investigación molecular ofrece un caso de uso inicial para probar esta infraestructura.

TRAYECTORIA ACADÉMICA

Investigación actual y trayectoria académica

Las publicaciones y la experiencia académica previas se presentan por separado del programa actual para aportar contexto sin confundir sus alcances.

Revisar trayectoria académica →